十三五期间，开发了一系列具有自主知识产权的DNA、RNA、SNP、microRNA、甲基化DNA等基因检测技术，这些技术快速灵敏、可靠性高，最大的优点就是成本远远低于现有所有检测技术，而且可同时满足快速定性和精确定量检测，具有很强的应用性和普及性。  

　　1.        超快速核酸扩增方法VPCR的建立及其应用  

　　传统PCR中，每个循环需要2-3分钟，整个PCR过程耗时1-2个小时，目前已报道的快速PCR技术大都基于新型加热仪器的开发，在应用推广方面存在很大的困难。课题组基于大量实践研究提出了革新性的PCR理论：PCR反应中的变性、退火、延伸三个步骤可以在动态的变温过程中实现，而不是一定要在传统的三个特定的温度点完成（图1）。基于该理论，我们在现有PCR仪器和体系的基础之上，开发出一种超快速核酸扩增方法VPCR，使核酸扩增的时间缩短至传统PCR的三分之一，最快可在8分钟内完成对1ng的lamdaDNA 基因组的扩增。 

　　图1. VPCR扩增理论及效果展示  

　　论文：Chen, R.; Lu, X.; Li, M.; Chen, G.; Deng, Y.; Du, F.; Dong, J.; Huang, X.; Cui, X.; Tang, Z.*, Polymerase Chain Reaction using "V" Shape Thermal Cycling Program. Theranostics 2019, 9 (6), 1572-1579. （一区，IF: 8.537）   

　　发明专利：唐卓，陈蓉，董娟. 一种快速扩增核酸的方法，201810647599.6。 

　　2.        基于LAMP的SNP分型方法的建立（PE-LAMP） 

　　基于LAMP技术，将常规的LAMP环引物设计成了短链的杂交探针，通过单个碱基的差异控制探针杂交的稳定性，由于探针能够促进LAMP扩增，由此形成了新的LAMP技术——探针促进的LAMP反应（PE-LAMP）。通过金属离子指示剂萘酚蓝（HNB）或pH指示剂中性红（N-red）的引入，实现了不开盖的快速可视化检测。该方法在对真实样本的分型检测中，其结果与测序结果一致，表明了其在现场诊断应用中的巨大潜力。 

　　图2. PE-LAMP技术原理及比色检测图示 　  

　　论文：Sheng Ding, Rong Chen, Gangyi Chen, Mei Li, Jiayu Wang, Jiawei Zou, Feng Du, Juan Dong, Xin Cui, Xin Huang, Yun Deng*, Zhuo Tang*, One-step colorimetric genotyping of single nucleotide polymorphism using probe-enhanced loop-mediated isothermal amplification (PE-LAMP). Theranostics online date 2019-4-16; doi:10.7150/thno.33980; in press （一区，IF8.537） 

　　3.        新型microRNA 单酶-比色检测方法 

　　以花青类染料DISC2(5)为信号报告分子，借鉴经典的stem-loop RT-PCR技术的设计理念设计相应的比色探针，引入多功能的DNA聚合酶TaqM1作为整个体系唯一的蛋白酶，建立了一种经济便捷的microRNA检测技术，检测原理如图3所示。该方法用非标记探针、经济型染料以及一种酶实现了检测结果的可视化、检测体系的简化，最低能够检测到5 fM的microRNA分子，显著区分一个碱基的差异，同时适用于总RNA和细胞裂解液中microRNA的检测。 

　　图3. 新型microRNA 单酶-比色检测原理 

　　论文：Dong, J.; Chen, G.; Wang, W.; Huang, X.; Peng, H.; Pu, Q.; Du, F.; Cui, X.; Deng, Y.; Tang, Z., Colorimetric PCR-Based microRNA Detection Method Based on Small Organic Dye and Single Enzyme. Anal Chem 2018, 90 (12), 7107-7111. （1区，IF6.042） 

　　4.      基于基因检测的贵重中药材真伪鉴定 

　　目前已开发了半夏、贝母、冬虫夏草、等多种中药材快速比色基因检测方法。其特色在于：检测成本低，适用于大规模的检测；结合基因快速提取技术，操作简单，方法快捷，从DNA提取到检测出结果只需要1个多小时；仪器门槛和操作难度降低；检测结果直观呈现，通过判断荧光就能知道中药材样品的真假。图4为贝母特异性基因鉴定结果展示。 

　　图4. 贝母基因鉴别结果展示 

　　5.      食品中动物源性成分的基因检测 

　　与成都市食品药品检验研究院合作开发了多种肉源性快速鉴定技术，并共同起草申请了《食品中多种动物源性成分检测实时荧光PCR法》，现已经国家市场监督管理总局批准并公告为食品补充检验方法（图5）。 

　　图5. 《食品中多种动物源性成分检测实时荧光PCR法》标准公示