通过温度、干旱胁迫下牧草（冷地早熟禾、多年生黑麦草、高羊茅、紫花苜蓿）比较转录组分析（图1，图2，图3），获得大量牧草抗逆候选基因，如许多转录因子、热激蛋白、细胞色素P450等家族基因，以及ABA受体蛋白基因、小分子糖代谢相关基因等。胁迫下，上调表达的基因通常具有提高抗逆特性的功能。验证了部分基因的抗逆功能。有望在进一步在牧草或其他作物抗逆分子育种中应用，以期培育适宜于高寒、干旱地区生长的抗逆牧草。  

　　图1. 高羊茅和多年生黑麦草高温和低温胁迫下，大量基因表达发生显著变化 

　　图2. 干旱和低温胁迫下，青海冷地早熟禾大量基因表达发生显著变化 

　　以热激蛋白转录因子基因(Heat Shock Facter, HSF)为例进行分析，获得青海冷地早熟禾72个，多年生黑麦草中 52个，高羊茅中74个。绝大多数在热胁迫下，表达显著上调，在热胁迫适应中发挥重要作用，为耐热候选基因（图3）。 

　　   图3. 热和冷胁迫下，高羊茅和多年生黑麦草热激蛋白转录因子表达情况